Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms