Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H3Q13889 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H3Q13889 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H3Q13889 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H3Q13889 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H3Q13889 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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