Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms