Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CBX3Q13185 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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