Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP1Q12981 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms