Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PTPN13Q12923 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PTPN13Q12923 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PTPN13Q12923 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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