Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms