Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms