Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PAX8Q06710 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms