Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE3AQ05086 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms