Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms