Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDM2Q00987 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms