Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms