Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK16Q00536 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms