Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HTD2P86397 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms