Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms