Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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