Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSX2P58304 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSX2P58304 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VSX2P58304 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms