Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMK1P53667 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms