Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2A1P52655 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms