Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ME1P48163 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ME1P48163 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ME1P48163 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms