Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms