Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP1P29466 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms