Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms