Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms