Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIG1P18858 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms