Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATF3P18847 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATF3P18847 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATF3P18847 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms