Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL6A2P12110 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms