Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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