Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA2O43364 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms