Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHF1O43189 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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