Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms