Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms