Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6BQ9NRW1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms