Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms