Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB9BQ9NP90 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB9BQ9NP90 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RAB9BQ9NP90 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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