Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms