Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1Q9HAT0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms