Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXQ1Q9C009 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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