Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms