Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD9AQ99638 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD9AQ99638 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms