Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms