Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1LQ96C74 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1LQ96C74 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms