Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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