Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAF7Q6Q0C0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms