Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL2Q6F5E8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL2Q6F5E8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms