Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO4Q6EEV6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms