Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG16L1Q676U5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms