Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB6CQ53S08 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms