Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms